Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNQ99608 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNQ99608 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNQ99608 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNQ99608 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDNQ99608 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NDNQ99608 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDNQ99608 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDNQ99608 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NDNQ99608 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDNQ99608 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NDNQ99608 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDNQ99608 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNQ99608 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNQ99608 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNQ99608 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNQ99608 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNQ99608 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDNQ99608 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDNQ99608 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDNQ99608 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDNQ99608 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDNQ99608 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDNQ99608 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDNQ99608 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDNQ99608 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDNQ99608 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDNQ99608 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNQ99608 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNQ99608 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNQ99608 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNQ99608 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNQ99608 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNQ99608 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNQ99608 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNQ99608 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNQ99608 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDNQ99608 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDNQ99608 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDNQ99608 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDNQ99608 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDNQ99608 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDNQ99608 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDNQ99608 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDNQ99608 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDNQ99608 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDNQ99608 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDNQ99608 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDNQ99608 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDNQ99608 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NDNQ99608 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDNQ99608 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDNQ99608 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDNQ99608 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NDNQ99608 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NDNQ99608 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDNQ99608 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDNQ99608 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDNQ99608 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDNQ99608 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDNQ99608 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDNQ99608 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNQ99608 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNQ99608 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNQ99608 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNQ99608 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNQ99608 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNQ99608 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNQ99608 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNQ99608 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDNQ99608 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDNQ99608 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDNQ99608 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDNQ99608 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNQ99608 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNQ99608 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNQ99608 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNQ99608 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNQ99608 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNQ99608 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNQ99608 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNQ99608 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNQ99608 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDNQ99608 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDNQ99608 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDNQ99608 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDNQ99608 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDNQ99608 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDNQ99608 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDNQ99608 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDNQ99608 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDNQ99608 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDNQ99608 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDNQ99608 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDNQ99608 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDNQ99608 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDNQ99608 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDNQ99608 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDNQ99608 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDNQ99608 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms