Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C2orf48Q96LS8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C2orf48Q96LS8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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