Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEURL4Q96JN8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NEURL4Q96JN8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEURL4Q96JN8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEURL4Q96JN8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms