Protein–RNA interactions for Protein: Q96JL9

ZNF333, Zinc finger protein 333, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF333Q96JL9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF333Q96JL9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF333Q96JL9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF333Q96JL9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF333Q96JL9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF333Q96JL9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF333Q96JL9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms