Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
COG3Q96JB2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COG3Q96JB2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
COG3Q96JB2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
COG3Q96JB2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms