Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MS4A3Q96HJ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A3Q96HJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms