Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX27Q96GQ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX27Q96GQ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX27Q96GQ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms