Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAPPC12Q8WVT3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC12Q8WVT3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC12Q8WVT3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms