Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCOLN3Q8TDD5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCOLN3Q8TDD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCOLN3Q8TDD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCOLN3Q8TDD5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms