Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTOSQ8NHW6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
OTOSQ8NHW6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTOSQ8NHW6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTOSQ8NHW6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTOSQ8NHW6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTOSQ8NHW6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTOSQ8NHW6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTOSQ8NHW6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms