Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C17orf47Q8NEP4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C17orf47Q8NEP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C17orf47Q8NEP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms