Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZD8Q8NEN9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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PDZD8Q8NEN9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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PDZD8Q8NEN9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDZD8Q8NEN9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZD8Q8NEN9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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