Protein–RNA interactions for Protein: Q8N988

ZNF557, Zinc finger protein 557, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF557Q8N988 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF557Q8N988 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF557Q8N988 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF557Q8N988 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF557Q8N988 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF557Q8N988 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF557Q8N988 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF557Q8N988 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF557Q8N988 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF557Q8N988 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms