Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ13

ZBED8, Protein ZBED8, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8Q8IZ13 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED8Q8IZ13 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED8Q8IZ13 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED8Q8IZ13 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms