Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOT2Q8IXI1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOT2Q8IXI1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT2Q8IXI1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT2Q8IXI1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT2Q8IXI1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT2Q8IXI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOT2Q8IXI1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms