Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SKAP1Q86WV1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SKAP1Q86WV1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SKAP1Q86WV1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms