Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC84Q86UT8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC84Q86UT8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC84Q86UT8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms