Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM29Q86T20 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMIM29Q86T20 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM29Q86T20 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM29Q86T20 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM29Q86T20 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM29Q86T20 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM29Q86T20 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM29Q86T20 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMIM29Q86T20 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms