Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCXQ7RTU7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCXQ7RTU7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCXQ7RTU7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms