Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHST9Q7L1S5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHST9Q7L1S5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHST9Q7L1S5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHST9Q7L1S5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms