Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
H2AFVQ71UI9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
H2AFVQ71UI9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2AFVQ71UI9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms