Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q71RC1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q71RC1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q71RC1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q71RC1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q71RC1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q71RC1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q71RC1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q71RC1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q71RC1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q71RC1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q71RC1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q71RC1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q71RC1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q71RC1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q71RC1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q71RC1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q71RC1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q71RC1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q71RC1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q71RC1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q71RC1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q71RC1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q71RC1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q71RC1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q71RC1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q71RC1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q71RC1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q71RC1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q71RC1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q71RC1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q71RC1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q71RC1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q71RC1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q71RC1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q71RC1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q71RC1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q71RC1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q71RC1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q71RC1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q71RC1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q71RC1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q71RC1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q71RC1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q71RC1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q71RC1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q71RC1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q71RC1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q71RC1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q71RC1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q71RC1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q71RC1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q71RC1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Q71RC1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q71RC1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Q71RC1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q71RC1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q71RC1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q71RC1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q71RC1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q71RC1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q71RC1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q71RC1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q71RC1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q71RC1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q71RC1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q71RC1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q71RC1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q71RC1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q71RC1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q71RC1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q71RC1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q71RC1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q71RC1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q71RC1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q71RC1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q71RC1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q71RC1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms