Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN12Q6ZSI9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN12Q6ZSI9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN12Q6ZSI9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms