Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSSK4Q6SA08 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK4Q6SA08 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSSK4Q6SA08 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms