Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE2Q6PIF2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE2Q6PIF2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE2Q6PIF2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms