Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CAVIN1Q6NZI2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAVIN1Q6NZI2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAVIN1Q6NZI2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAVIN1Q6NZI2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms