Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EFCAB12Q6NXP0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
EFCAB12Q6NXP0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFCAB12Q6NXP0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms