Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RALGAPA1Q6GYQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms