Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
WDR78Q5VTH9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
WDR78Q5VTH9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
WDR78Q5VTH9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms