Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
OBSCNQ5VST9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms