Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms