Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4J0

GCNT6, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT6Q5T4J0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNT6Q5T4J0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNT6Q5T4J0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNT6Q5T4J0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms