Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRAMEF19Q5SWL8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRAMEF19Q5SWL8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms