Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WASHC2DQ5SRD0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WASHC2DQ5SRD0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms