Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COLEC12Q5KU26 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COLEC12Q5KU26 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms