Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLHL40Q2TBA0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KLHL40Q2TBA0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KLHL40Q2TBA0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KLHL40Q2TBA0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms