Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MICAQ29983 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MICAQ29983 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MICAQ29983 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MICAQ29983 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MICAQ29983 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MICAQ29983 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MICAQ29983 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MICAQ29983 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MICAQ29983 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MICAQ29983 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MICAQ29983 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MICAQ29983 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MICAQ29983 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MICAQ29983 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MICAQ29983 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICAQ29983 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICAQ29983 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICAQ29983 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICAQ29983 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICAQ29983 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MICAQ29983 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MICAQ29983 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MICAQ29983 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MICAQ29983 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MICAQ29983 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MICAQ29983 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MICAQ29983 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MICAQ29983 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MICAQ29983 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MICAQ29983 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICAQ29983 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICAQ29983 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICAQ29983 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICAQ29983 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICAQ29983 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICAQ29983 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICAQ29983 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICAQ29983 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MICAQ29983 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MICAQ29983 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MICAQ29983 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MICAQ29983 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICAQ29983 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICAQ29983 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICAQ29983 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICAQ29983 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICAQ29983 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICAQ29983 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICAQ29983 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICAQ29983 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MICAQ29983 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICAQ29983 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICAQ29983 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICAQ29983 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICAQ29983 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICAQ29983 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICAQ29983 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MICAQ29983 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MICAQ29983 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MICAQ29983 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MICAQ29983 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MICAQ29983 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MICAQ29983 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MICAQ29983 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICAQ29983 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICAQ29983 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICAQ29983 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICAQ29983 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICAQ29983 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICAQ29983 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MICAQ29983 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICAQ29983 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICAQ29983 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICAQ29983 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICAQ29983 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICAQ29983 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICAQ29983 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICAQ29983 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MICAQ29983 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms