Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SWI5Q1ZZU3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SWI5Q1ZZU3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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