Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAMA3Q16787 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAMA3Q16787 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAMA3Q16787 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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