Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXT1Q16394 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXT1Q16394 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXT1Q16394 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXT1Q16394 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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