Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCOLCEQ15113 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCOLCEQ15113 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCOLCEQ15113 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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