Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMCO1Q147U7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMCO1Q147U7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMCO1Q147U7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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