Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPARCL1Q14515 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPARCL1Q14515 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPARCL1Q14515 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
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