Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VGLL4Q14135 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VGLL4Q14135 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms