Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SHROOM2Q13796 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SHROOM2Q13796 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.85
SHROOM2Q13796 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
SHROOM2Q13796 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
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