Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CUL1Q13616 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CUL1Q13616 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
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