Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf61Q13536 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf61Q13536 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
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