Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMED1Q13445 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMED1Q13445 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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