Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM32Q13049 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM32Q13049 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM32Q13049 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
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