Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HSPB3Q12988 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HSPB3Q12988 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HSPB3Q12988 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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